主人公の唯我成幸は、一ノ瀬学園に通う高校3年生。一ノ瀬学園には歴代の生徒の中でも特に優秀な生徒に限り、大学進学にかかる全ての費用を学校側が負担する特別VIP推薦の制度があり、貧しい家族に楽な生活をさせたいと願う成幸はその推薦を獲得すべく日夜勉学に励んでいたものの、理系科目で緒方理珠に、文系科目では古橋文乃に後れをとっていた。
そんな中、成幸は推薦の審査面談にて学園長から条件付きで推薦を許可される。その条件とは、「理珠と文乃の2人の教育係に就き、2人が志望する大学に合格させる」ということだった。しかし、2人はいずれも他人が羨む才覚を持ちながらも、それぞれ不得手な分野に強い憧れや将来の夢を見いだしており、理系科目が得意な理珠は文系の大学、文系科目が得意な文乃は理系の大学をそれぞれ志望していた。いずれも志望科目の成績は壊滅的で、またいずれも天性の才覚に頼るタイプであるため、互いに得意科目を教え合うのも上手くいかない。さらに成幸は、スポーツ特待生だが勉強全般が苦手な武元うるかの面倒も見ることになる。
彼女たちが抱える、本気で打ち込みたいことが上手くいかない苦しみに共感するところのあった成幸は、才能に恵まれずとも努力で自分の成績を伸ばしてきた今までの経験を生かして勉強の仕方を教え、彼女たちの希望する進路を尊重しようと奮闘する。また前任の教育係であり、自身の苦い経験から、無謀な夢を諦めさせて天賦の才能を生かす方向に導くべきだとして成幸の方針に批判的な立場を取る教師の桐須真冬にも、どうにか歩み寄り、方針を認めてもらおうとする。
学園の文化祭には、カップルが成立するジンクスがあり、起点にルートが分岐する。
Nariyuki Yuiga is a senior high school student attending Ichinose Academy who, in order to secure a university scholarship, must tutor three female geniuses in different subjects: Fumino Furuhashi is a genius in humanities, but horrible at science and mathematics; Rizu Ogata is a genius in science and mathematics, but terrible at humanities; and Uruka Takemoto is a genius on the athletic field, but dreadful in academics. As the girls work with Nariyuki to achieve their academic goals, they must also deal with their growing feelings for him. As the story progresses, two other girls are focused upon: Mafuyu Kirisu, their teacher who despite her professionalism, is a slob at home, and Asumi Kominami, a rōnin who has the appearance of a middle schooler despite her age.