序章(第1~2巻)
- 姉弟のような関係で一つ屋根に暮らし、2年前に失踪した叔母・天音から「ワタシヲミツケテ」というメールを受け取った天海陸は、添付された写真の撮影場所と思しき廃病院「風間病院」へと駆け込む。病院を溜まり場としていた不良達にリンチにあった所を、幼い頃の顔馴染みである武部洋平と、同級生の美少女・有栖川レナが現れ、窮地を救われる。
- 難を逃れたもつかの間、携帯電話の着信に出た不良達たちが化け物に変貌する。洋平たちはその化け物を『棺守』と呼び、『刃旗』という武器で殲滅していく。棺守から逃げようとする陸であったが、追い詰められたその時、謎の繭から発せられた光が棺守の体を滅ぼしていった。
- 翌日、謎の繭から生まれた、失踪した天音と瓜二つの幼女ネーネは、棺守にさらわれてしまい、陸は瀕死の重傷を負ってしまう。その時、ネーネは力を発動させて、陸を「自我を保ったままの棺守」へと変えてしまう。洋平らが所属する『F・L・A・G』に拘束された陸は、自分が72時間以内に自我を失い、棺守になってしまうことを知る。
- そんな中、陸とネーネを手中に収めるために、圧倒的な力を持っている刃旗狩りのタカオがF・L・A・G本部に突入してくる。タカオにより洋平が瀕死の重傷を負い、洋平は陸の自我を残すために自分の刃旗を陸に与えて、棺守になる前に自分を殺すよう陸に頼んで亡くなる。
第一部(第3~7巻)
- 洋平の能力を受け継いだ陸は、F・L・A・Gに加わることになる。その後もネーネは、陸と共に戦闘に遭遇するたびに奇跡的な力を発現させ、それに伴って身体的にも成長していく。
- そしてある時任務を遂行中に「感染源」と名乗る謎の人物に遭遇。「感染源」とF・L・A・Gとの戦いの末、ネーネが消失。陸とレナは消息を絶ってしまう。
初実島追想(第8巻)
- 消息を絶った陸とレナは「感染源」唐沢の記憶をたどり物語の鍵を握る初実島の過去を知る。
第二部(第9~13巻)
- 陸とレナが戻ってきて平穏な時間が流れていた矢先に、柩姫天音による刃旗狩りや人類集団棺守化が行われる。
- 世界の命運を懸け、陸は柩姫天音との決戦へ向かう。柩姫天音の真意とは?棺守とは何か?その全ての謎が明らかになる。
At the start of the series, high-schooler Riku Amami receives a cellphone picture from his dead stepsister, Amane, with a hospital in the background. When he visits the said building, he is attacked by electromagnetic monsters called Kanshu, which travel and reproduce using cellphone signals: if a human hears his cellphone giving off an eerie static sound, his body is then gruesomely converted into a Kanshu or suffers irreversible infection. Riku is saved by two warriors, Rena and Youhei, who wield Jinki weapons designed to destroy Kanshu. During the battle, however, Riku finds a cocoon, out of which hatches a toddler looking exactly like Amane. As the situation goes downhill, Riku ends up receiving his own Jinki and gets drawn into the shadowy organization that fights the Kanshu.