[Comic Set] 沈黙の艦隊 : ยุทธการใต้สมุทร จบ (เล่ม1-16)

日本の近海で海難事故が発生。千葉県犬吠埼沖で、海上自衛隊の潜水艦「やまなみ」がソ連の原子力潜水艦と衝突し圧潰沈没、艦長の海江田四郎二等海佐以下「やまなみ」全乗員76名の生存が絶望的と報道されて日本に衝撃を与える。

海江田の同期でその死を疑う海上自衛隊潜水艦「たつなみ」艦長・深町洋二等海佐の予想どおり、海江田以下「やまなみ」乗員は生存していた。彼らは日米が共謀で極秘に建造した日本初の原子力潜水艦「シーバット」の乗員に選抜されており、事故は彼らを日本初の原潜に乗務させるための偽装工作だった。

アメリカ海軍第7艦隊所属となった日本初の原潜「シーバット」は、海江田の指揮のもと高知県足摺岬沖での試験航海に臨む。しかしその途中、海江田は突如艦内で全乗員と共に反乱を起こし、音響魚雷で米海軍の監視から姿をくらまし逃亡。以降、海江田を国家元首とする独立戦闘国家「やまと」を名乗る。さらに出港時、「シーバット」改め「やまと」は核弾頭を積載した可能性が高い事が発覚する。

アメリカ合衆国大統領のニコラス・J・ベネットは、卓越した政治手腕を振るい、海江田を危険な核テロリストと断定して抹殺を図ろうとする。海江田は天才的な操艦術と原潜の優れた性能、核兵器などを武器に、アメリカやロシアなどの海軍を撃破していく。